1. 脫氮效果比較
常規A2O工藝由于好氧池出水回流到缺氧池，因此在好氧池中生成的硝態氮被反硝化去除。除氨氮和總氮效果非常好。但由于反硝化反應需要在有足夠碳源的條件下完成，污水在經歷過前端厭氧過程后，有機物已不同程度的被降解，若原污水有機物含量低，反硝化將受到一定影響。
倒置A2O工藝，有無內回流對氮的去除效果影響比較大，雖然此工藝缺氧段碳源已經不是制約因素，無內回流的工藝脫氨氮比較好，但脫總氮的效果不好，因為在好氧池形成的硝態氮沒有被完全反硝化脫除。具有內回流的工藝脫氨氮和總氮效果很好，是比較理想化的脫氮工藝。
2. 除磷效果比較
常規A2O工藝除磷不好，因為厭氧環境受各方面的影響，首先原污水進入厭氧池，其中含有一定量O2，其次，從二沉池回流的污泥中含有硝態氮。這兩個制約因素使厭氧環境并不處于嚴格的厭氧狀態，使其首先進行一段缺氧過程，導致厭氧時間不夠，影響PAOs釋磷，進而影響好氧階段磷的攝取，影響除磷效果。
倒置A2O工藝由于將厭氧好氧位置交換，回流的硝態氮被完全反硝化去除，厭氧環境不受其他因素的影響，所以此工藝除磷效果比較好。但由于PAOs厭氧釋磷需要碳源，前段缺氧反硝化亦需碳源，所以若原水有機物含量低，污水到達厭氧階段時，有機物含量已經很低，可能會影響工藝的除磷效果。
3. 池容的比較
為使工藝效果達到以佳，規定所有工藝外回流比R＝1和內回流比r＝4。厭氧釋磷要達到以好的效果，PAOs必須在厭氧環境呆夠1小時。微生物在池中的停留時間跟水力停留時間有關，而污染物在水中的停留時間不與回流比、流態和池形等因素有關，對于一個特定的工藝是一定值。 4、工藝優化 （1）對于常規A2O工藝，其缺點在于厭氧時間不夠，因此可以適當增大厭氧區的體積，或在回流污泥回流到厭氧池之前增設預缺氧池。 （2）可以采用分點進水的方式來對常規A2O改進。一部分直接進厭氧池，剩余部分以分點方式進入缺氧池和好氧池，因為在缺氧和好氧池分點進水，形成局部的缺氧好氧環境，硝化和反硝化交替進行。氮被脫除完全，回流污泥中含硝態氮很少，不對厭氧階段的釋磷產生影響。而且厭氧釋磷和后續缺氧反硝化都有足夠的碳源支持。 （3）對于已有的氧化溝工藝，要想增強其的除磷能力，可以考慮改成倒置A2/O。 （4）對于NH3-N含量不高或對總氮脫除率要求不高的，無內回流的倒置A2/O工藝以適合。
